ولد الامام علي الهادي (عليه السلام) في قرية تسمى: بصريا- قرية أسسها الإمام موسى بن جعفر (عليه السلام)- تقع في نواحي المدينة المنورة.

اختلف المحدثون في تاريخ ولادته إلى أقوال عدة:

١- ما ذكره الشيخ المفيد (رحمه الله): كانت للنصف من ذي الحجة سنة اثنتي عشرة ومائتين.

٢- ما ذكره ابن عياش: كانت في الثاني من شهر رجب، أو الخامس منه.

٣- وقيل في الليلة الثالثة عشر من شهر رجب سنة ٢١٤.

٤- وقيل في النصف من ذي الحجة، أو السابع والعشرين منه.

ومما يؤيد القول بولادته في شهر رجب، الدعاء المروي عن الإمام المهدي (عجل الله تعالى فرجه الشريف): " اللهم إني أسألك بالمولودين في رجب: محمد بن علي الثاني وابنه علي بن محمد المنتجب...".